El parque tiene objetivos de conservación
Objetivos de conservación:
1. Conservar áreas naturales poco intervenidas para la realización de investigaciones científicas, actividades recreativas y educación ambiental.
2. Proteger espacios productores de bienes y servicios ambientales.
3. Preservar el mayor centro de heterogeneidad ambiental y alta biodiversidad biológica concentrada en el refugio del Napo.
4. Conservar un importante centro de endemismo, así como valores sobresalientes de fauna y flora, paisajes, reliquias históricas, culturales y arqueológicas.
5. Perpetuar en estado natural muestras de comunidades bióticas, regiones fisiográficas, unidades biogeográficas, recursos genéricos y especies silvestres en vía de extinción.